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微生物シークエンス(微生物同定)

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微生物シークエンス(微生物同定)の特長

・日本薬局方準拠の「遺伝子解析による微生物の迅速同定法」に基づき、微生物の解析を行います。
・細菌に対しては、16S rRNAの高度可変領域の一部または全長、真菌に対しては18S rRNA と5.8S rRNA間のスペーサー領域(ITS1)をPCR増幅後、シークエンス解析を行ないます。

また、弊社では1営業日で解析結果を報告するオプションサービスもご用意しております。


 

微生物同定の参考文献

The Japanese Pharmacopoeia 15th edition
Rapid Identification of Microoganisms Based on Molecular Biological Method
pp1741-1742(March 31,2006 The MHLW Ministerial Notification No.285)

微生物シークエンス(微生物同定)の価格・納期

微生物シークエンス(微生物同定)

    価格 納期
細菌あるいは真菌 DNA抽出~PCR増幅~
シークエンス~BLAST検索
¥15,000/サンプル 約1週間※2
不明※1 ¥20,000/サンプル 約1週間※2
全長解析(細菌のみ) ¥28,000/サンプル 約1週間※2

※1 細菌、真菌の判断がご依頼以前にご不明の場合の解析となります。
※2 サンプル数、受注状況により納期が前後することがございます。

オプション

  価格 納期
超特急・微生物同定  + ¥30,000/サンプル 1営業日


※サンプルが午前中に弊社へ到着した営業日を0カウントとし、翌営業日のご報告となります。
※受注状況により当オプションはご利用できない場合がございます。事前にお問い合わせください。
※当オプションにつき、最長3営業日以上の納期を頂戴せざるを得なくなった場合は、料金は頂戴いたしません。

 

微生物シークエンス (微生物同定)に使用するプライマー

  プライマー名 配列
細菌同定プライマー 10F 5'-GTTTGATCCTGGCTCA
800R 5'-TACCAGGGTATCTAATCC
真菌同定プライマー ITS1F 5'-GTAACAAGGT(T/C)TCCGT
ITS1R 5'-CGTTCTTCATCGATG
細菌全長解析用プライマー 27F 5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG
1492R 5'-GGCTACCTTGTTACGACTT

 

ご依頼・サンプル送付方法

1.当ページ下部からオーダーフォームをダウンロードしてご依頼内容をご記入ください。
 

2.オーダーフォームにご記入後、E-mailに添付して送信してください。
 

3.以下の送付物を梱包して弊社ラボまでお送りください。
 

・プリントアウトしたオーダーフォーム
・単離された菌株を展開した寒天培地※冷蔵でお送り下さい。

送付先

株式会社ベックス
〒173-0004 東京都板橋区板橋2-61-15 4F
TEL. 03-5375-1071

微生物シークエンス(微生物同定)の納品内容

E-mail

・波形データ(PDF)
・塩基配列(テキスト形式)
・BLAST検索の結果(登録配列と一致率の高い上位10個の菌名)

郵送

・作業報告書

微生物シークエンス(微生物同定)のご注意

・弊社では、試料の単離作業は行っておりません。純粋培養された菌株からの受け入れとなります。
・病原性を有する可能性のある菌株の受け入れは行っておりません。
・PCRはDNA抽出も含め、最大2回まで行いますが、2回目でも産物が得られない場合は作業中止とさせていただきます。
・微生物シークエンスを2回行っても明確な波形が得られず、解析不能塩基数が弊社出荷基準値を上回った場合は、定価の半額を頂戴いたします。
・弊社では菌種同定判断までは対応しておりません。得られたBLAST検索結果よりお客様にご判断していただくことになります。
・お送りいただいたサンプルは機密保持に基づき厳重に処分いたします。
・サンプルをお送りいただく際、送料はお客様ご負担となります。

ご注文

オーダーフォームに必要事項をご記入の上、下記アドレスまでご送信下さい。
E-mail :info@bexnet.co.jp

BEX_microbialseq_orderform.xls

 


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